Информация о проекте

1. Наименование проекта Сравнительно-геномный анализ регуляторных систем про- и эукариот
2. Регистрационный номер ЦИТИС: 125011400261-3
3. Исполнитель Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
4. Ведомственная принадлежность Минобрнауки России - наука
5. Заказчик Минобрнауки России
6. Вид финансирования ГЗ
7. Вид НИОКТР Фундаментальная НИР
8. Приоритетное направление (основное), согласно Указу Президента Российской Федерации от 7 июля 2011 года № 899 Науки о жизни
9. Приоритетное направление (дополнительное), согласно Указу Президента Российской Федерации от 7 июля 2011 года № 899 Нет данных
10. Критическая технология (основная), согласно Указу Президента Российской Федерации от 7 июля 2011 года № 899 Геномные, протеомные и постгеномные технологии
11. Критическая технология (дополнительная), согласно Указу Президента Российской Федерации от 7 июля 2011 года № 899 Нет данных
12. Приоритет Стратегии НТР России, согласно Указу Президента Российской Федерации от 28 февраля 2024 г. № 145 Переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий
13. Приоритетное направление научно-технологического развития РФ, согласно Указу Президента Российской Федерации от 18 июня 2024 года № 529
14. Важнейшая наукоемкая технология (основная), согласно Указу Президента Российской Федерации от 18 июня 2024 года № 529
15. Важнейшая наукоемкая технология (дополнительная), согласно Указу Президента Российской Федерации от 18 июня 2024 года № 529
16. Общее тематическое направление Персонализированная медицина и высокотехнологичное здравоохранение и здоровьесбережение
17. Приоритетное арктическое направление (основное) Арктическая медицина
18. Приоритетное арктическое направление (дополнительное) Арктическая биология и биотехнологии
19. Аннотация Задачей данного исследования является изучение особенностей организации бактериальных и эукариотических хромосом при адаптации организмов к новым условиям жизни - например, при попадании прокариотических патогенов в организм хозяина или при развитии патологий в различных клетках человека. Будет оптимизирован алгоритм анализа данных ChIP-seq для исключения артефактных сайтов связывания регуляторных белков и протестирован на данных для регуляторов E. coli, обеспечивающих переключение метаболизма при попадании в организм хозяина. Будет оптимизирован алгоритм предсказания сайтов протеазного узнавания и создан атлас протеаз, разрезающих белки патогенов при их попадании в организм человека. В рамках изучения организации бактериальных и эукариотических хромосом будет оценена степени участия ключевых “глобальных” транскрипционных факторов и белков нуклеоида E. coli в поддержании конформации хромосомы с помощью Hi-C; будут построены ортологические ряды архитектурных белков про- и эукариот для сопоставления филогенетических паттернов и реконструкции их эволюционной истории. Будет составлен каталог локальных структур хроматина эукариот, включая структуры хроматина разных типов клеток человека в норме и патологии. Отдельной задачей в рамках данного исследования является реконструкция метаболических путей и анализ метаболического потенциала микробных сообществ, находящихся в составе многолетнемерзлых отложений Арктики и фумарольных почв замерзших вулканов. Это, с одной стороны, даст информацию о возможности депонирования и эмиссии газов, в частности, метана, внося вклад в анализ углеродного баланса, с другой, исследование сообществ разных слоев многолетнемерзлых почв даст представление о направлении их эволюции и, возможно, поможет предсказать пути дальнейшего изменения климата.
20. Начало проекта 15.10.2024
21. Завершение проекта 31.12.2028